Es fallen für alle Teilnehmer am System GeldKarte einheitliche Transaktionskosten in Höhe von 0,3 Prozent des Umsatzes bzw. mindestens 1 Eurocent je Umsatz an. Diese Kosten sind nicht verhandelbar.
Zusätzlich berechnen die Kreditinstitute unterschiedliche Gebühren für die Bereitstellung der Händlerkarten, die Buchungsposten und ggf. den Kontoauszug.
Die Kosten können in Abhängigkeit von Kreditinstitut, Rechenzentrum und Evidenzzentrale durch Zusammenfassung von Umsätzen sehr stark variieren. Lt. Angabe der Frankfurter Sparkasse bietet man dort z. B. die folgenden Optionen an:
- Einzelgutschrift pro Summensatz (Kassenabschluss)
- Sammelgutschrift pro Händlerkarte
- Sammelgutschrift pro Händler (als ein Gesamtbetrag pro Tag)
- Sammelgutschrift pro Referenznummer (alle Umsätze mit gleicher Referenznummer z.B. Tour werden zusammengefasst)
Die ZKA-Entgelte werden seitens der Frankfurter Sparkasse monatlich entweder pro Händlerkarte oder pro Händler als Gesamtbetrag per Lastschrift eingezogen.
Das Beispiel der Frankfurter Sparkasse zeigt den großen Verhandlungsspielraum auf.

